Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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