Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr29B1ARI9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr29B1ARI9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms