Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gm5640A3KG49 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5640A3KG49 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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