Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms