Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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