Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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PtprfA2A8L5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms