Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Akap17bA2A3V1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Akap17bA2A3V1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Akap17bA2A3V1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Akap17bA2A3V1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Akap17bA2A3V1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Akap17bA2A3V1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Akap17bA2A3V1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Akap17bA2A3V1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Akap17bA2A3V1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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