Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Hdac6Q9Z2V5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hdac6Q9Z2V5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
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Hdac6Q9Z2V5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Hdac6Q9Z2V5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Hdac6Q9Z2V5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Hdac6Q9Z2V5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac6Q9Z2V5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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