Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms