Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn9Q9Z0S7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn9Q9Z0S7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn9Q9Z0S7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn9Q9Z0S7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn9Q9Z0S7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn9Q9Z0S7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn9Q9Z0S7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn9Q9Z0S7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn9Q9Z0S7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Cldn9Q9Z0S7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Cldn9Q9Z0S7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn9Q9Z0S7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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