Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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