Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms