Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnt3Q9QZ47 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
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