Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms