Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms