Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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