Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Riox1Q9JJF3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Riox1Q9JJF3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Riox1Q9JJF3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Riox1Q9JJF3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Riox1Q9JJF3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Riox1Q9JJF3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Riox1Q9JJF3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Riox1Q9JJF3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Riox1Q9JJF3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Riox1Q9JJF3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Riox1Q9JJF3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Riox1Q9JJF3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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