Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rb1cc1Q9ESK9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rb1cc1Q9ESK9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms