Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms