Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms