Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms