Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Smg9Q9DB90 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Smg9Q9DB90 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Smg9Q9DB90 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Smg9Q9DB90 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Smg9Q9DB90 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Smg9Q9DB90 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Smg9Q9DB90 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Smg9Q9DB90 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Smg9Q9DB90 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Smg9Q9DB90 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Smg9Q9DB90 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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