Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121 ms