Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fip1l1Q9D824 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms