Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms