Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nop56Q9D6Z1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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