Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubgcp4Q9D4F8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms