Protein–RNA interactions for Protein: Q9D180

Cfap57, Cilia- and flagella-associated protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap57Q9D180 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap57Q9D180 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms