Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms