Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrs1Q9CYH6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms