Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms