Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fcf1Q9CTH6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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