Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ifitm3Q9CQW9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ifitm3Q9CQW9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ifitm3Q9CQW9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifitm3Q9CQW9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifitm3Q9CQW9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ifitm3Q9CQW9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifitm3Q9CQW9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ifitm3Q9CQW9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ifitm3Q9CQW9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ifitm3Q9CQW9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ifitm3Q9CQW9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifitm3Q9CQW9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ifitm3Q9CQW9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifitm3Q9CQW9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifitm3Q9CQW9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifitm3Q9CQW9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifitm3Q9CQW9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifitm3Q9CQW9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifitm3Q9CQW9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifitm3Q9CQW9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifitm3Q9CQW9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifitm3Q9CQW9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifitm3Q9CQW9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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