Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ykt6Q9CQW1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ykt6Q9CQW1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ykt6Q9CQW1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ykt6Q9CQW1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ykt6Q9CQW1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ykt6Q9CQW1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ykt6Q9CQW1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ykt6Q9CQW1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ykt6Q9CQW1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ykt6Q9CQW1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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