Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufb9Q9CQJ8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb9Q9CQJ8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms