Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms