Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms