Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap2Q9CPW0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap2Q9CPW0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms