Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1b4Q99ME6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms