Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nmd3Q99L48 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms