Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Hps4Q99KG7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hps4Q99KG7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hps4Q99KG7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hps4Q99KG7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hps4Q99KG7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hps4Q99KG7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hps4Q99KG7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps4Q99KG7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps4Q99KG7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps4Q99KG7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps4Q99KG7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps4Q99KG7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps4Q99KG7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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