Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdk9Q99J95 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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