Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klc3Q91W40 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klc3Q91W40 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms