Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ttc39cQ8VE09 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ttc39cQ8VE09 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ttc39cQ8VE09 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ttc39cQ8VE09 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ttc39cQ8VE09 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ttc39cQ8VE09 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ttc39cQ8VE09 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ttc39cQ8VE09 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ttc39cQ8VE09 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ttc39cQ8VE09 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc39cQ8VE09 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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