Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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