Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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