Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Polr1eQ8K202 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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