Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Card11Q8CIS0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Card11Q8CIS0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms