Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog3Q8CI04 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms