Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd4lQ8CFI0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms